一、基本信息
刘涛，博士，讲师
电子邮件：liutao2023@hubu.edu.cn
研究方向：CRISPR-Cas系统分子机制，基因编辑分子工具开发，新型可编程核酸酶的挖掘与应用研究
社会兼职：中国微生物学会会员、湖北省合成生物学学会会员
二、教育经历
2013.09–2018.06 华中农业大学，微生物学，博士
2009.09–2013.06 华中农业大学，理学学士学位
三、工作经历
2023.1至今 3344体育会员 讲师
2018.07–2022.12 华中农业大学生命科学技术学院，博士后
四、科研项目
1. 国家自然科学基金青年项目：病毒Cas4蛋白影响冰岛硫化叶菌CRISPR-Cas系统免疫适应的机制研究，25万元，2020.01-2022.12，主持；
2. 博士后创新人才支持计划: CRISPR-Cas系统间隔序列在原发适应过程中特异性整合的机制研究，60万元，2018.09-2020.08，主持;
3. 中国博士后科学基金第64批面上一等资助：CRISPR-Cas系统原发适应驱动基因组微进化的研究，8万元，2019.01-2020.12，主持；
4. 国家自然科学基金重大研究计划培育项目：云南高温热泉嗜热古菌碳氮硫元素代谢机制的研究，80万元，2018.01-2020.12，参与；
5. 国家自然科学基金面上项目：古菌B家族DNA聚合酶执行跨损伤合成分子机制的研究，58万元，2020.01-2023.12，参与；
6. 湖北洪山实验室重大项目：合成下一代益生菌活体生物药物，150万，2022.1-2024.12，参与;
7. 湖北洪山实验室重大项目：具有我国自主知识产权的新型基因编辑系统的开发与利用，200万，2022.1-2024.12，参与。
五、发表论文（#并列一作，*通讯作者）：
1. Liu T, Liu Z, Ye Q, Pan S, Wang, X, Li Y, Peng W, Liang Y, She Q, Peng N*. Coupling transcriptional activation of CRISPR–Cas system and DNA repair genes by Csa3a in Sulfolobus islandicus. Nucleic Acids Res. 2017, 45(15): 8978-8992.
2. Liu T; Li Y; Wang X; Ye Q; Li H; Liang Y; She Q; Peng N*. Transcriptional regulator-mediated activation of adaptation genes triggers CRISPR de novo spacer acquisition, Nucleic Acids Res, 2015, 43(2): 1044~1055
3. Liu T, Xu Y, Wang X, Ye Q, Liu Z, Zhang Z, Liu J, Yang Y, Peng X, Peng N*. DNA motifs and an accessory CRISPR factor determine Cas1 binding and integration activity in Sulfolobus islandicus. Int J Mol Sci, 2022, 23(17): 10178.
4. Liu T; Pan S; Li Y; Peng N*; She Q, Type III CRISPR/Cas System: Introduction and its application for genetic manipulations, Current Issues in Molecular Biology, 2017, 26: 1~13
5. Cao J; Wang Q; Liu T; Peng N; Huang L*, Insights into the post-translational modifications of archaeal Sis10b (Alba): lysine-16 is methylated, not acetylated, and this does not regulate transcription or growth, Molecular Microbiology, 2018, 109(2): 192~208
6. 刘涛, 王晓婕, 李英俊, 彭楠*. 冰岛硫化叶菌遗传操作体系的研究进展，微生物学通报, 2019, 46(2): 398~406.
7. Zhang Z, Pan S, Liu T, Li Y, Peng N*. Cas4 Nucleases Can Effect Specific Integration of CRISPR Spacers. J Bacteriol, 2019, 201(12): e00747-18.
8. Liu Z, Sun M, Liu J, Liu T, Ye Q, Li Y, Peng N*. A CRISPR-associated factor Csa3a regulates DNA damage repair in crenarchaeon Sulfolobus islandicus. Nucleic Acids Res, 2020, 48(17): 9681-9693.
9. Ye Q, Zhao X, Liu J, Zeng Z, Zhang Z, Liu T, Li Y, Han W and Peng N*. CRISPR-Associated Factor Csa3b Regulates CRISPR Adaptation and Cmr-Mediated RNA Interference in Sulfolobus islandicus. Frontiers in Microbiology, 2020,11: 2038.
10. Wang X#, Wu B#, Sui X, Zhang Z, Liu T, Li Y, Hu G, He M* and Peng N*. CRISPR-mediated host genomic DNA damage is efficiently repaired through microhomology-mediated end joining in Zymomonas mobilis. J Genet Genomics, 2021, 48 (2): 115-122 (cover paper).
11. Sui X, Wang X, Liu T, Ye Q, Wu B, Hu G, Yang S, He M*, Peng N*. Endogenous CRISPR-assisted microhomology-mediated end joining enables rapid genome editing in Zymomonas mobilis. Biotechnol Biofuels, 2021, 14(1): 208.
12. Liu L, Yang D, Zhang Z, Liu T, Hu G, He M, Zhao S, and Peng N*. Endogenous CRISPR-Cas system-mediated high-efficient genome editing in Pediococcus acidilactici enhances cell growth and lactic acid production. Appl Environm Microbiol. 2021, 87(20): e0094821.
