作物基因组学与遗传育种团队
一、 团队成员
杨平仿,博士,教授,博士生导师,中科院“百人计划”人才,团队负责人。2002年6月华中农业大学硕士毕业,2005年6月中科院植物研究所博士毕业。2005年7月–2005年11月中科院植物研究所任实习研究员;2007年3月–2009年12月美国密歇根州立大学Jianping Hu’s Lab, DOE–Plant Research Laboratory工作;2010年1月–2018年9月中科院武汉植物园任研究员;2018.10至今3344体育会员任教授。亚洲大洋洲农业蛋白质组组织(AOAPO),委员;中国植物学会种子专业技术委员会,委员;中国生物化学与分子生物学会蛋白质组专业委员会,委员;中国园艺学会水生蔬菜专业委员会,常务理事;湖北省遗传学会、湖北省晶体学会、湖北省生物信息学会,理事;Frontiers in Plant Science,编委;Scientific Reports,编委;PLoS One,编委;植物科学学报,编委。Email: yangpf@hubu.edu.cn。
何冬丽,博士,副教授,硕士研究生导师。2004年7月华中农业大学农学系油菜遗传育种专业硕士毕业,2008年6月中国科学院水生生物研究所藻类遗传专业博士毕业。2010年4月–2018年11月中国科学院武汉植物园水生植物基因组学与育种课题组任副研究员;2018年12月至今3344体育会员任副教授。研究领域:植物种子生物学、蛋白质组学。Email: hedongli@hubu.edu.cn。
李明,博士,副教授,硕士研究生导师。2010年7月海南大学/中国热带农业科学院橡胶研究所硕士毕业,2014年7月中国科学院武汉植物园博士毕业。2014年7月–2018年11月中国科学院武汉植物园任副研究员;2018年12月至今 3344体育会员任副教授。研究领域:以种子萌发和逆境胁迫机理解析为主要生物学问题,采用蛋白质组学,蛋白质翻译后修饰组学实验手段,并结合经典分子遗传学技术开展具体研究工作。Email: limit@hubu.edu.cn。
余锋,博士,副教授、硕士研究生导师。2010年6月华中农业大学植物科学技术学院植物科学与技术专业学士毕业,2016年6月华中农业大学3344体育会员遗传学专业博士毕业。2016年7月–2018年6月华中农业大学植物科学技术学院博士后;2018年6月–2019年9月仲恺农业工程学院农业与生物学院任副教授;2019年10月至今3344体育会员工作,现任副教授。研究领域:作物基因组学与遗传育种。Email: yufeng@hubu.edu.cn。
柯应根,博士,副教授,硕士生导师。2005年7月华中农业大学生命科学技术学院学士毕业,2014年4月华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室博士毕业。2014年7月–2020年6月华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室任博士后/副研究员;2020年11月至今3344体育会员任副研究员。研究方向:水稻调控“生长-抗逆”间平衡的分子机制;水稻对高温的响应机制及水稻耐高温基因的挖掘。Email: ygke@hubu.edu.cn。
二、 代表性研究成果
1、水稻种子萌发调控的分子机理:
综合利用定量比较蛋白质组学和修饰蛋白质组学挖掘鉴定在水稻在水稻种子萌发过程中具有关键作用的蛋白质及其编码基因,并对其调控水稻种子萌发的机理进行深入探讨。
1)多层次蛋白质组学分析:
2)关键基因的功能分析:
2、水稻组织发育的多组学分析:
综合利用单分子测序技术和质谱技术对水稻不同组织进行系统的转录组学和蛋白质组学(包括磷酸化修饰组学)分析,研究水稻基因的动态表达特点
3、水稻抗高温机理解析:
综合利用生化及分子遗传技术,挖掘水稻的耐热基因、解析分子基础及研究其在育种中的应用。
1)利用公共数据库中的转录组数据,挖掘高温响应基因:
2) 关键基因的功能分析:
三、 代表性学术论文
1. Li M, Zhang H, He D, Damaris R, Yang P (2022) A stress-associated protein OsSAP8 modulates gibberellic acid biosynthesis by reducing the promotive effect of transcription factor OsbZIP58 on OsKO2. J Exp. Bot. 73: 2420–2433
2. Yu F, Li M, He and D, Yang P (2021) Advances on Post-translational Modifications Involved in Seed Germination. Frontiers in Plant Sci 12:642979.
3. He D, Li M, Damaris RN, Bu C, Xue J, Yang P (2020) Quantitative ubiquitylomics approach for characterizing the dynamic change and extensive modulation of ubiquitylation in rice seed germination. Plant J. 101(6):1430-1447.
4. Zhang H, Li M, He D, Wang K, Yang P (2020) Mutations on ent-kaurene oxidase 1 encoding gene attenuate its enzyme activity of catalyzing the reaction from ent-kaurene to ent-kaurenoic acid and lead to delayed germination in rice. PLoS Genet. 16(1):e1008562.
5. Hu Z, Damaris RN, Yang P (2020) Mechanism of GA-mediated leaf sheath growth in rice: a proteomic Approach. Plant Growth Regulation 91:23–36.
6. Li M, Chen X, He D, Yang P (2020) Proteomic analysis reveals that calcium channel blockers affect radicle protrusion during rice seed germination. Plant Growth Regulation 90:393–407.