一、基本信息
彭文舫，博士，副教授，硕士研究生导师，2017年湖北省省级人才项目获得者
电子邮件：wenfang(at)hubu.edu.cn
研究领域：微生物遗传学、CRISPR-Cas病毒免疫机制、基因编辑
二、教育背景
2012.07–2015.03 丹麦哥本哈根大学，理学博士
2010.09–2015.06 华中农业大学，理学博士
2005.09–2008.07 中国农业科学院，农学硕士
2001.09–2005.07 长江大学，农学学士
三、工作经历
2017.07至今 3344体育会员，副教授
2015.11–2017.06 3344体育会员，讲师
2008.08–2010.08 中国农业科学院油料作物研究所，研究助理
四、科研/教改项目
（一）主持项目
1. 湖北大学教学建设项目（2020C01）：微生物遗传学（双语）精品课程，在研
2. 湖北省人才计划专项经费（2017–2022），负责人
3. 湖北省自然科学基金面上项目（2017CFB538），基于嗜热古菌冰岛硫化叶菌CRISPR-Cas系统的DNA/RNA编辑平台的搭建和优化，结题
4. 湖北省教育厅青年人才项目（Q20161007），利用酵母内质网滞留系统促进人凝血因子IX（FIX）高活性表达的研究，结题
5. 湖北大学青年科学基金，冰岛硫化叶菌多个CRISPR-Cas系统病毒免疫协作机制，结题
（二）参与项目
1. 国家自然科学基金面上项目（31870057），酿酒酵母内质网滞留信号介导的蛋白质滞留效应研究，在研
2. 丹麦独立研究（自然科学类）基金项目（DFF-1323-00330），Functional analyses of archaeal Cas/Cmr modules and their integration and cooperation in antiviral defense，258万丹麦克朗，结题
3. 国家自然科学基金海外及港澳学者合作研究基金（31128011），极端嗜热古菌CRISPR/Cas系统的功能研究，结题
4. 国家自然科学基金面上项目（30471062），花生种子贮藏蛋白在抗黄曲霉产毒中的作用与遗传分化，结题
5. 国家自然科学基金面上项目（30571132），中国花生核心种质的构建及重要新基因源发掘，结题
五、发表论文（#共同第一作者，*通讯作者）
（一）第一或通讯作者科研论文
1. Li J.#, Wang B.#, Yang Q., Si H., Zhao Y., Zheng Y.*, Peng W.* (2022). Enabling efficient genetic manipulation in a rare actinomycete Pseudonocardia alni Shahu. Frontiers in Microbiology. 13: 848964.
2. Hao Y., Wang Q., Li J., Yang S., Zheng Y.*, Peng W.* (2022). Double nicking by RNA-directed Cascade-nCas3 for high-efficiency large-scale genome engineering. Open Biology. 12(1): 210241.
3. Hu X.#, Liu H.#, Li J., Wang J., Peng W.* (2021). Protein macrocyclization by a recombinant asparaginyl endopeptidase. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 53(11): 1567–1570.
4. Zheng Y., Li J., Wang B., Han J., Hao Y., Wang S., Ma X., Yang S., Ma L., Yi L.*, Peng W.* (2020). Endogenous Type I CRISPR-Cas: From Foreign DNA Defense to Prokaryotic Engineering. Frontiers in Bioengineering & Biotechnology. 8: 62.
5. Zheng Y., Han J., Wang B., Hu X., Li R., Shen W., Ma X., Ma L., Yi L.*, Yang S.*, Peng W.* (2019). Characterization and repurposing of the endogenous Type I–F CRISPR–Cas system of Zymomonas mobilis for genome engineering. Nucleic Acids Research 47(21): 11461–11475.
6. Peng W., Feng M., Feng X., Liang Y. X., She Q.* (2015). An archaeal CRISPR type III–B system exhibiting distinctive RNA targeting features and mediating dual RNA and DNA interference. Nucleic Acids Research 43(1): 406-417.
7. Peng W., Li H., Hallstrom S., Peng N., Liang Y. X., She Q.* (2013). Genetic determinants of PAM–dependent DNA targeting and pre-crRNA processing in Sulfolobus islandicus. RNA Biology 10(5): 738–748.
（二）合作作者科研论文
1. Xie X.-H., Fu X., Yan X.-Y., Peng W.-F., Kang L.-X.* (2021). A broad-specificy chitinase from Penicillium oxalicum k10 exhibits antifungal activity and biodegradation properties of chitin. Marine Drugs. 19: 356.
2. Lv Y.#, Jiang Y.#, Peng W., Fang Y., Dong W., Zhou J., Xin F.*, Zhang W.* Jiang M.* (2021). Genetic manipulation of non-solvent-producing microbial species for effective butanol production. Biofuels, Bioproducts & Biorefining. 15(3): 119–130.
3. Guo F.#, Dai Z.#, Peng W., Zhang S., Zhou J., Ma J., Dong W., Zhou J., Xin F.*, Zhang W.* Jiang M.* (2021). Metabolic engineering of Pichia pastoris for malic acid production from methanol. Biotechnology & Bioengineering. 118(1): 357–371.
4. Lu J., Peng W., Lv Y., Jiang Y., Xu B., Zhang W., Zhou J., Dong W., Xin F.*, Jiang M.* (2020). Application of cell immobilization technology in microbial cocultivation systems for biochemicals production. Industrial & Engineering Chemistry Research 59: 17026–17034.
5. Shen W., Zhang J., Geng B., Qiu M., Hu M., Yang Q., Bao W., Xiao Y., Zheng Y., Peng W., Zhang G., Ma l., Yang S.* (2019). Establishment and application of a CRISPR-Cas12a assisted genome–editing system in Zymomonas mobilis. Microbial Cell Factory 18: 162.
6. Fan X., Li X., Zhou Y., Mei M., Liu P., Zhao J., Peng W., Jiang Z.-B., Yang S., Iverson B. L., Zhang G.*, Yi L.* (2019). Quantitative Analysis of the Substrate Specificity of Human Rhinovirus 3C Protease and Exploration of Its Substrate Recognition Mechanisms. ACS Chemical Biology 15: 63–73.
7. Han W.#, Li Y.#, Deng L., Feng M., Peng W., Hallstrom S., Zhang J., Peng N., Liang Y. X., White M. F. White, She Q.* (2017). A type III-B CRISPR-Cas effector complex mediating massive target DNA destruction. Nucleic Acids Research 45(4): 1983–1993.
8. He F., Vestergaard G., Peng W., She Q., Peng X.* (2017). CRISPR-Cas type I-A Cascade complex couples viral infection surveillance to host transcriptional regulation in the dependence of Csa3b. Nucleic Acids Research 45(4): 1902–1913.
9. Liu T., Liu Z., Ye Q., Pan S., Qang X., Peng W., Li Y., Liang Y. X., She Q., Peng N.* (2017). Coupling transcriptional activation of CRISPR-Cas system and DNA repair genes by Csa3a in Sulfolobus islandicus. Nucleic Acids Research, 45(15): 8978–8992.
10. Mei M., Zhou Y., Peng W., Yu C., Ma L., Zhang G.*, Yi L.* (2017). Application of modified yeast surface display technologies for non–antibody protein engineering. Microbiological Research 196: 118–128.
11. Mei M., Zhai C., Li X., Zhou Y., Peng W., Ma L., Wang Q., Iverson B. L., Zhang G.*, Yi L.* (2017). Characterization of aromatic residue-controlled protein retention in the endoplasmic reticulum of Saccharomyces cerevisiae. Journal of Biological Chemistry, 292(50): 20707–20719.
12. Garrett R. A.*, Shah S. A., Erdmann S., Liu G., Mousaei M., Leon-Sobrino C., Peng W., Gudbergsdottir S., Deng L., Vestergaard G., Peng X., She Q. (2015). CRISPR-Cas adaptive immune systems of the Sulfolobales: Unravelling their complexity and diversity. Life (Basel) 5(1): 783–817.
六、授权专利
（一）第一发明人
1. 彭文舫，郝怡乐（2022）一种基于CRISPR-nCas3系统的高效基因组大片段删除方法及应用（ZL202110639401.1）
2. 彭文舫，郝怡乐（2022）一种含nCas3单链核酸酶切酶的工程菌、制备方法及应用（ZL202110639403.0）
3. 彭文舫，郝怡乐（2022）一种nCas3单链核酸酶切酶及其应用（ZL202110638175.5）
4. 彭文舫，杨世辉，郑艳丽，易犁，马立新（2021）基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的基因组大片段高效删除方法及其应用（ZL201910692120.5）
5. 彭文舫，杨世辉，郑艳丽，易犁，马立新（2021）基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的多基因位点同时编辑方法及其应用（ZL201910692118.8）
6. 彭文舫，胡晓韵，易犁，范贤，马立新（2021）一种AEP环化酶在毕赤酵母中的表达方法及其应用（ZL201910712032.7）
7. 彭文舫，胡晓韵，易犁，范贤，马立新（2021）一种AEP环化酶在大肠杆菌中的融合表达方法、AEP环化酶环化能力鉴定方法及其应用（ZL201910712666.2）
（二）非第一排名发明人
1. 杨世辉，彭文舫，郑艳丽，易犁，马立新（2021）一种基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的基因编辑方法及其应用（ZL201910692143.6）
2. 杨世辉，沈威，彭文舫，马立新（2021）一种基于CRISPR–Cas12a系统的运动发酵单胞菌基因编辑方法及其应用（ZL201910692112.0）
3. 张桂敏，卢争辉，袁芯，彭文舫，石云云，蒋思婧，马延和（2021）一种特异性调节枯草芽孢杆菌外源基因表达的dcas9–ω融合蛋白及其应用.（ZL201710965231.X）
4. 杨世辉，彭文舫，沈威，郑艳丽，易犁，马立新（2021）一种基于运动发酵单胞菌的CRISPR–Cas系统、基因组编辑体系及其应用（PCT/CN2019/112556）
5. 易犁，范贤，彭文舫，周瑜，喻婵，张桂敏（2020）一种切割效率增强的HRV 3C蛋白酶底物突变体及其应用.（ZL201710956966.6）
6. 易犁，周瑜，张桂敏，彭文舫，马立新，马延和 (2020) 一组不同启动子介导的蛋白酶高通量筛选载体及筛选方法（ZL201510802312.9）
